在使用CNKI进行查重时，常见问题包括查重结果不准确、查重速度慢、查重报告不完整等。解决方法包括适当调整查重参数、优化网络环境、及时更新软件版本等。

CNKI查重中还可能遇到的问题有：查重系统闪退、无法上传文件、查重报告无法打开等。解决方法可尝试重新安装软件、清理缓存、更换浏览器等。